年欧洲肿瘤内科学会（ESMO）年会以线上形式召开，中国临床专家与思路迪共同合作的41项研究成果亮相此次ESMO年会。今天汇报跨癌种的临床研究结果，覆盖免疫治疗、靶向治疗和基因变异特征分析等多个领域，从临床实际问题出发，为中国肿瘤患者的精准治疗提供更多科学依据。
例泛癌肿大数据：MSI-H与基因融合共变异分析（Minioralpresentation）
医院与思路迪合作，基于例泛癌种患者数据分析MSI-H与基因融合共变异的关联性。研究结果表明，MSI-H在子宫癌（11.03%）、肠癌（7.85%）、胃癌（4.98%）中占比较高。与MSS样本相比，MSI-H样本中的基因融合发生率更高(3.06%vs.1.99%,OR=1.56,P=0.)。这种相关性在肠癌中更显著(OR=21.73,P=1.64*10-12)，在例MSS肠癌样本中仅有9例发生基因融合（0.20%），而在例MSI-H样本中检测到16例基因融合（4.17%）。
万例中国实体瘤患者人群DNA损伤修复基因缺陷的泛癌种分析（poster#）
本研究纳入例实体瘤患者，包括NSCLC在内的共计24种瘤种。7.6%的人群中存在DDR基因体细胞突变，突变频率最高前五个瘤种分别为子宫内膜癌（26%）、膀胱癌(13.53%)、小肠癌(12.40%)、结肠直肠(11.40%)及宫颈癌(10.50%)。而在DDR胚系突变人群中，卵巢癌人群的比例最高（14.92%），其次是前列腺癌（11.69%）和小细胞肺癌（10.67%）。DDR通路突变频率越高TMB水平也更高，回归分析表明20个DDR基因与TMB显著相关（P0.01）。DDR基因变异的子宫内膜、肠癌和胃癌人群中，约43%的人群表现为TMB-L/MSS，而具有POLE、CHEK2、BRAD1、FANCC、BRCA1以及FANCG基因其中之一突变的患者，相对其他DDR基因，其TMB-H/MSS的比例更高。进一步分析对比胚系和体细突变人群TMB水平，胚系DDR基因变异的实体瘤患者人群的TMB水平低于体细胞突变的人群。
IDH突变中国实体瘤中肿瘤突变负荷的分布（poster#）
医院与思路迪医学部共同合作，探索IDH突变的实体瘤肿瘤突变负荷（TMB）特征。研究共纳入例IDH突变的实体瘤患者，包括胆管癌81例、肝癌66例、肺癌85例、结直肠癌61例、胃癌24例，利用思路迪NGSpanel对患者组织标本进行NGS检测。结果显示，IDH突变肺癌、结直肠癌和胃癌患者的TMB均显著高于胆管癌(p=0.,p0.,p=0.,respectively)。此外，还分析了IDH突变/野生型与胆管癌患者TMB的关系，发现IDH突变胆管癌患者的TMB低于IDH野生型患者(p=0.)。
中国人群实体瘤ROS1融合特征（poster#）
研究纳入超过4万例患者，NGS方法检测ROS1融合形式。其中92例患者中包含了24种不同的ROS1融合，10种是已有文献报告的，14种为新的融合形式。在所有ROS1融合中，肺癌占最大比例，为89.1％；肝癌、结直肠癌、胃癌，脂肪肉瘤等癌种中也检测到了ROS1融合。最常见的ROS1融合伴侣为CD74，EZR和SDC4。新的融合形式DCBLD1-ROS1于3例肺癌患者中被检测到。这些结果提示NGS是一种有效的检测融合的方法，尤其是针对新的未知的ROS1融合形式。
中国人群实体瘤RET融合特征（poster#）
研究共纳入4万余例患者，NGS方法检测RET融合形式。其中例患者中包含了29种不同的RET融合，13种是已有文献报告的，16种为新的融合形式。在所有RET融合中，仍然是肺癌占最大比例，为88.6％；结直肠癌占比其次占5.5%；甲状腺癌、乳腺癌、肝癌、胰腺癌、胃癌卵巢癌等癌种中也检测到了RET融合。最常见的RET融合伴侣为KIF5B，CCDC6和NCOA4。新的融合形式TIMM23B-RET与NCOA43–RET为共变异类型，这两个融合形式同时出现在11例患者中，其中4例肺癌患者，6例结直肠癌患者，1例肝癌患者。这些结果提示NGS是一种有效的检测融合的方法，尤其是针对新的未知的RET融合形式。
中国人群实体瘤NTRK融合特征（poster#）
研究共纳入4万余例患者，NGS方法检测NTRK融合形式。其中17例患者中包含了11种不同的NTRK融合，4种是已有文献报告的融合伴侣（CD74,ETV6,IRF2BP2,andLMNA），7种为新的融合融合伴侣（AGBL1,ASH1L,CGN,DCAF12,DDX10,DMD,LIPI）。在所有NTRK融合中，仍然是肺癌占最大比例，为52.9％；肝癌、结直肠癌、甲状腺癌，软组织肉瘤等癌种中，也都检测到了NTRK融合。最常见的NTRK融合伴侣为ETV6和LMNA。新的融合形式LIPI-NTRK1于3例肺癌患者中被检测到。这些结果提示NGS是一种有效的检测融合的方法，尤其是针对新的未知的ROS1融合形式。
中国实体瘤患者PTPRT基因突变特征及其与TMB的相关性分析（poster#）
医院与思路迪医学部合作，探索PTPRT基因突变特征及其作为免疫治疗疗效预测biomarker的可能性。研究共纳入了例中国实体瘤患者，回顾性分析了PTPRT基因突变特征，及其与TMB、PD-L1表达相关性，同时利用MSKCC免疫治疗队列，验证了其对免疫治疗疗效的预测作用。结果显示，思路迪队列中4.4%实体瘤患者携PTPRT非同义变异，其中PTPRT突变排名前五的肿瘤依次是膀胱/尿道肿瘤（11.2%）、子宫内膜癌（8.3%）、结直肠癌（7.4%）、食管癌（6.6%）和胃癌（5.5%）。PTPRT突变中，missense比例高达83.7%，其次是frameshiftindel(6.1%),nonsense(6.1%),non-frameshiftindel(2.0%),splice(2.0%)。研究发现，思路迪的MSS型患者中，携带PTPRT突变患者相比于野生型TMB水平（11vs5muts/Mb,P0.）和PD-L1阳性率均更高（P=0.）。MSKCC的MSS型患者中，携带PTPRT突变患者有更高的TMB水平（22vs6）和更长的生存期（41movs15mo,HR0.54,95%CI0.41to0.72）。
利用机器学习预测肿瘤来源（poster#）
临床专家与思路迪共同合作，利用上万例测序结果，提取点突变，拷贝数变化和融合信息，利用机器学习预测肿瘤来源，准确性接近60%，其中肾癌，肠癌，肝癌，肺癌的精确率较好。后续会进行继续优化，提高模型表现。
PD-L1表达/TMB与免疫细胞浸润的相关性分析:一项泛实体瘤研究（poster#）
研究纳入例中国恶性肿瘤患者，收集FFPE组织样本，进行多重免疫组化荧光检测(mIHC)。其中58例患者的样本同时接受了NGS检测。在例患者中，36%为胃肠肿瘤，35%为肝胆和胰腺肿瘤，22%为非小细胞肺癌，8%为其他肿瘤类型。结果显示CD8+T细胞和巨噬细胞M1细胞浸润与PD-L1表达呈正相关。通过NGS测序和mIHC进一步探讨了TMB与免疫细胞浸润的相关性。CD8+T细胞和NK细胞浸润与TMB-H呈正相关。PD-L1表达阳性肿瘤中，CD8+T细胞和巨噬细胞M1细胞浸润程度较高，而TMB-H肿瘤中CD8+T细胞和NK细胞浸润程度较高。
预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇