GI15胰腺癌基因突变图谱哪些基因

编者按

  在胃肠癌症研讨会上,澳大利亚分子生物科学研究所SeanGrimmond博士作“胰腺癌基因突变图谱”主题演讲。《肿瘤瞭望》前方记者聆听了这场重要讲座,并将这场讲座要点进行梳理,撷取精华内容,以飨读者。

  1、AU_PACA计划简介

  癌症是基因疾病,可通过下一代测序技术(NGS)检测所有遗传损伤。国际癌症基因组联盟检测了例患者,50类肿瘤,对基因组、表观基因组、转录组进行了检测,以找出全部的肿瘤突变,揭示每类肿瘤的基因突变途径,从而确定肿瘤亚型,研发新疗法。

  2、胰腺癌(PACA)的基因突变机制

  去氨基:5-甲基胞嘧啶去氨基后导致CT转录;

  APOBEC家族:DNA脱氨酶参与了病毒防御和反转录转座子沉默,可能与炎症相关;

  HR基因缺陷:DNA双股断裂修复缺陷,BRCA1、BRCA2、PALB2基因的致病突变,以及其他突变;

  食管:DNA氧化损伤导致GT异型碱基的置换;

  错配修复:MSH表达缺失导致突变增强。

  3、哪些基因突变导致PACA

  PACA的驱动基因如图所示:

  4、PACA的分子分型

  根据患者基因组完整性特点,将胰腺癌分为稳定型、分散型、集中型、不稳定型。

  导致胰腺导管腺癌(PDAC)的突变

  (1)基因组不稳定:12%;

  (2)RNF43突变:8%;

  (3)RNA加工缺陷:8%;

  (4)ROBO-SLIT-SRGAP缺陷:7%;

  (5)ATM突变:6%;

  (6)KRAS野生型:7%;

  (7)HER-2基因扩增:3%;

  (8)MET基因扩增:2%;

  (9)……

  PACA的基因组不稳定性

  5、PACA的治疗

  药物治疗PACA的疗效研究显示,7/8不稳定型PACA患者/患者异种移植模型(PDXs)对顺铂治疗有响应,0/7的稳定型PACA患者/患者异种移植模型(PDXs)对顺铂治疗有响应。

  除了PACA,存在基因组不稳定的癌种如下所示:

  胰腺导管腺癌(PDAC):BRCA2GL突变和杂合性丢失(LOH),4.5mut/mb;

  胰腺神经内分泌瘤(PNET):体细胞BRCA2突变细胞发生纯合性缺失(HD),6mut/mb;

  卵巢浆液性癌(HGSC):BRCA1基因甲基化和杂合性丢失,3mut/mb;

  艾氏腹水癌(EAC):BRCA2体细胞突变和杂合性丢失,5mut/mb。

  6、未来研究方向

(来源:《肿瘤瞭望》编辑部)

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