单细胞分析18个健康组织和器官中常见12

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当今CAR-T,双抗,ADC,单抗越来越遭到资源的喜爱,许多公司也大搞特搞,开采许多项目,这些开采的抗体序列都要考证稀奇性好不好,一般做个结构穿插反响或许膜卵白阵列懂得,是不是有脱靶的或许性;反过来想一下,你选的这个靶抗原在人体安康的结构器官是不是抒发,抒发量高下,才是立项的关键点。

该文章从单细胞RNA-seq(scRNA-seq)方面懂得了来自正凡人体模范的18个结构和器官中罕见的个靶抗原抒发形式。即使不是卵白层面的懂得,但照旧有参考意义的。

造血和免疫系统

除了众人所熟知的CD19,CD20,CD22等在B祖细胞(ProgB),老练B细胞和浆母细胞中高度抒发外,CD在造血干细胞/祖细胞(HSPCs)中剧烈抒发,比如造血干细胞(HSC),淋巴引发的多能祖细胞(LMPP),巨核细胞祖细胞(ProgMk)和ProgB,说明CD做为靶标或许引发骨髓毒性。有事理的是,EPCAM和MUC1靶抗原在红系祖细胞(ProgRBC)高抒发。。

非免疫结构和器官

EGFR、CD34、FAP、ROR2、AXL、ERBB2、IL3RA、KIT、PROM1、KDR、EPHA2、CD、MET、MME、ROR1、FOLH1、GPC3在意内皮细胞(EC)、成纤维细胞平宁滑肌细胞(SMC)中高度抒发。

肺的上皮成份(肺泡1型细胞AT1,肺泡2型细胞AT2,纤毛细胞和基底细胞)剧烈抒发多种靶抗原,如SDC1,MUC1,EPHA2,EGFR,TNFRSF10B,CD38,CD4,PROM1,MUC16,PSCA,ERBB2,GPC3,CLDN18,FOLR1,MSLN,MET,EPCAM,FOLH1和CEACAM5。中筛选这些靶抗原时,应留意防备肺损伤,这在抗ERBB2CAR-T调节后肺损伤的病例汇报中已有描绘。

ROR2,EGFR,GPC3,MET,EPCAM和ERBB2在各式安康的胰腺细胞群中普及抒发。SDC1、MME、AFP、FOLH1、FOLR1、GPC3、ROR1、TNFRSF10B、MET、EGFR和ERBB2在肾上皮中充实抒发。

推想B系联系靶抗原的平安性

较量了CD19、MS4A1(CD20)、CD22、TNFRSF17、SDC1、CD38、SLAMF7和TNFRSF8这七个基因在平常结构和器官中的抒发形式。CD19和MS4A1对其余造血谱系险些没有影响,是消除B系衍生细胞的梦想靶标。CD22在B系衍生的细胞和ASDC中抒发,CD38和SLAMF7在非B系中一般含量充实,比如pDC,T淋巴细胞和NK细胞。

CD38和TNFRSF8在意脏成纤维细胞,SMC和EC中抒发,提醒抗CD38和抗CD30CAR-T细胞的潜在意脏毒性。CD38和SDC1抒发形式暴露了抗CD38和抗CDCAR-T细胞的肺毒性和肝毒性。

推想AML联系靶抗原的平安性

懂得平常结构和器官中罕见AML联系靶抗原(CD33,CD和CLEC12A)的抒发:

CLEC12A在mRNA水准的血小板中的频次高于CD33和CD,但在卵白结构上根本不抒发。

CD在各式器官的EC中含量充实,比如心脏EC,肺EC,皮肤EC,肝脏EC和膀胱EC,靶向该抗原或许致使内皮稀奇叉反响性和内皮细胞毒性;CD33、CD和CLEC12A存在于少量肺上皮细胞中。

推想CD33靶抗原毒性几率低于CD和CLEC12A靶点。别的,CD-CAR-T或许会伤害浑身内皮系统,而CLEC12A-CAR-T偏向于侵犯平常的淋巴细胞。

推想实体瘤联系靶抗原的平安性

scRNA-seq水准上懂得各式结构和器官中的罕见靶抗原GPC3,B4GALNT1和HER2:HER2和GPC3在免疫细胞典型中抒发。HER2-CAR-T细胞或许消除CD8TEM,NK细胞和骨髓细胞;GPC3-CAR-T细胞或许侵犯一部份稚童T淋巴细胞。

GPC3在意脏和积极脉成纤维细胞中含量充实,B4GALNT1在意脏和积极脉SMC中含量充实,ERBB2(Her2)在意脏成纤维细胞和积极脉SMC中含量充实;

靶向这些抗原或许会伤害皮肤的性能,由于皮肤成纤维细胞抒发GPC3,皮肤周细胞抒发B4GALNT1,毛囊联系细胞高水准抒发ERBB2(Her2)。

B4GALNT1是一个相对梦想的靶标,但靶向GPC3和ERBB2或许致使某些结构中严峻的靶向肿瘤外毒性。

本来,CAR或许双抗等靶标抗原的卵白抒发形式比在scRNA-seq显示的mRNA抒发形式更繁杂,憧憬单细胞卵白质组学的文章颁发。

参考文件:

"Single-CellAnalysisofTargetAntigensofCAR-TRevealsaPotentialLandscapeof“On-Target,Off-TumorToxicity”."Frontiersinimmunology12().

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